Antibiorésistance

La résistance aux antibiotiques ou antibiorésistance désigne la capacité d’une bactérie à résister aux effets des antibiotiques.

L’efficacité des antibiotiques a provoqué leur utilisation massive en santé humaine et animale et a créé une pression de sélection sur les populations bactériennes, entraînant l'apparition de souches résistantes. Lorsqu'on emploie un antibiotique, seules survivent les bactéries dotées de systèmes de défense contre cette molécule. La mauvaise utilisation des antibiotiques – traitements trop courts, trop longs ou à posologies inadaptées – fait partie des facteurs d’apparition de ces résistances.

La résistance aux antibiotiques est devenue l'une des plus grandes menaces pour la santé à l’échelle mondiale. Les bactéries résistantes sont déjà à l’origine de plus de 700 000 décès chaque année dans le monde et dans les 35 prochaines années, le bilan annuel pourrait s'élever à 10 millions de décès.

On dispose de peu d'informations sur la résistance aux antibiotiques dans les pays à faible revenu et plus particulièrement dans les régions et au sein des populations où Médecins Sans Frontières (MSF) intervient. La raison en est l’absence de laboratoire d’analyse bactériologique. De ce fait, les traitements antibiotiques sont souvent prescrits de manière empirique et peuvent donc s’avérer inefficaces si l'infection est due à des bactéries résistantes.

Epicentre travaille à mieux décrire les infections bactériennes graves et leur résistance aux antibiotiques afin de renforcer l'usage rationnel des antibiotiques. C'est fondamental si l'on veut limiter l’expansion de la résistance aux antibiotiques.

Afin de mieux comprendre l'ampleur et la nature du problème, Epicentre concentre ses efforts à décrire l’épidémiologie de la résistance aux antibiotiques dans la communauté et dans les hôpitaux où MSF intervient.

A titre d’exemple, on peut citer les infections bactériennes invasives chez les enfants de moins de 5 ans acquises en communauté ou à l'hôpital (bactériémies et méningites) en Afrique subsaharienne, les ostéomyélites qui affectent les blessés de guerre au Moyen-Orient et les infections chez les patients souffrant de brûlures graves en Haïti^1-7.

Les comparaisons entre l'Afrique de l'Ouest, l'Afrique de l'Est et le Moyen-Orient indiquent qu'il existe des variations considérables à la fois dans les types et les niveaux de résistance aux antibiotiques. Il est nécessaire de comprendre la complexité et les différences locales et d’en tenir compte pour adapter les protocoles thérapeutiques.

Epicentre suit l'évolution de la résistance aux antibiotiques dans ses centres de recherche au Niger et en Ouganda depuis de nombreuses années et a observé une expansion inquiétante de la multirésistance. Notre étude de 2008 sur la septicémie chez les enfants nigériens n'avait révélé aucune résistance des Entérobactéries à la ceftriaxone ¹, mais les résultats de l’étude conduite en 2018 montrent que 15% de ces germes sont devenus résistants à cet antibiotique. De même, en Ouganda, entre 2009 et 2012, 2 % des cas de méningite étaient résistants à la ceftriaxone alors que nous en avions 9% dans les cas de bactériémies en 2015-2016 ².

L'étude menée par Epicentre au Niger en 2017 sur le portage de bactéries intestinales multirésistantes indique des niveaux élevés de consommation d'antibiotiques dans la population générale. Au total, 90 % de la population (tous âges confondus) est porteuse de bactéries multirésistantes ⁸.

Les examens bactériologiques pour toutes les études conduites au Niger et en Ouganda sont faits dans Les laboratoires des centres de recherche d’Epicentre du Niger et de l'Ouganda ; ils fournissent des données importantes dans les pays ou régions qui n’ont qu’un accès restreint à des examens bactériologiques de qualité.

Par ailleurs, d'importantes collaborations avec des laboratoires de référence nous permettent d'affiner nos recherches et d'étudier plus en détail des mécanismes de résistance, grâce à la biologie moléculaire par exemple.

References

¹ Page A-L, de Rekeneire N, Sayadi S, Aberrane S, Janssens A-C, Rieux C, et al. Infections in children admitted with complicated severe acute malnutrition in Niger. PLoS One. 2013 Jan;8(7):e68699. 
² Page A-L, Boum Y, Kemigisha E, Salez N, Nanjebe D, Langendorf C, et al. Aetiology and outcomes of suspected infections of the central nervous system in Children in Mbarara, Uganda. Sci Rep. 2017;7(1). 
³ Teicher CL, Ronat J-B, Fakhri RM, Basel M, Labar AS, Herard P, et al. Antimicrobial drug-resistant bacteria isolated from Syrian war-injured patients, August 2011-March 2013. Emerg Infect Dis [Internet]. 2014 Nov [cited 2018 May 21];20(11):1949–51. 
⁴ Murphy RA, Nisenbaum L, Labar AS, Sheridan RL, Ronat J-B, Dilworth K, et al. Invasive Infection and Outcomes in a Humanitarian Surgical Burn Program in Haiti. World J Surg [Internet]. 2016 Jul 25 [cited 2018 May 21];40(7):1550–7. 
⁵ Bernabé KJ, Langendorf C, Ford N, Ronat J-B, Murphy RA. Antimicrobial resistance in West Africa: a systematic review and meta-analysis. Int J Antimicrob Agents. 2017 Nov;50(5):629–39. 
⁶ Isanaka S, Langendorf C, Berthé F, Gnegne S, Li N, Ousmane N, et al. Routine amoxicillin for uncomplicated severe acute malnutrition in children. N Engl J Med. 2016;374(5). 
⁷  Langendorf C, Le Hello S, Moumouni A, Gouali M, Mamaty A-A, Grais RF, et al. Enteric bacterial pathogens in children with diarrhea in niger: Diversity and antimicrobial resistance. PLoS One. 2015;10(3). 
⁸  Coldiron ME, Assao B, Page A-L, Hitchings MDT, Alcoba G, Ciglenecki I, et al. Single-dose oral ciprofloxacin prophylaxis as a response to a meningococcal meningitis epidemic in the African meningitis belt: A 3-arm, open-label, cluster-randomized trial. PLoS Med. 2018;15(6).